台灣寵物常見疾病依排序分別為：鰴菌症、皮膚疥癬蟲症、過敏(跳蚤過敏症)、外耳炎、耳疥蟲、腸胃炎、感冒(上呼吸道感染)、牙結石、牙周病、心臟病、結膜炎。
再來由品種來個別介紹牠們常見疾病:
中小型犬
博美犬: 膝蓋骨易位，氣管塌陷，鼻淚管不通。
瑪爾濟斯: 心臟病，膝蓋骨易位，淚腺炎，氣管塌陷。
吉娃娃: 有長毛和短毛是體型最小，神經質，牙齒發育不全，囟門(頭蓋骨癒合不全)未癒合，氣管塌陷，心臟病，膝蓋骨易位。
迷你品: 氣管塌陷，心臟病(老年)。
迷你型貴賓狗: 膝蓋骨易位，心臟病，鼻淚管不通，犬全面漸進性視網膜萎縮症。
臘腸犬: 有長毛和短毛，易胖體質，椎間盤疾病，耳炎，犬漸進性視網膜退化症，先天性心臟病。
約克夏: 膝蓋骨易位，牙齒發育不全(雙排牙)，氣管塌陷。
北京狗: 眼球脫出，乾眼症，氣管塌陷，氣喘，鼻淚管不通。
西施犬: 易胖體質，眼球脫出，乾眼症，氣管塌陷。
柴犬: 皮膚病(雙層毛)，青光眼 ，髖關節發育不良症。
雪納瑞: 白內障 泌尿道結石 雪納瑞面皰症候群 耳炎，鼻淚管不通，犬全面漸進性視網膜萎縮症。
巴哥犬: 易胖體質，眼球外凸，乾眼症，短鼻子，氣管塌陷，氣喘。
柯基犬: 關節發育不良症，椎間盤疾病，進行性視網膜退化，易胖體質。
米格魯(又稱英國獵兔犬): 聰明，可塑性高，易胖體質，耳炎。
