甲狀腺是位於頸前基部三分之一處氣管的兩旁。甲狀腺是體內的內分泌腺體，能分泌甲狀腺素(是一種賀爾蒙)。因此當甲狀腺的功能失常，無論甲狀腺素分泌過多或過少，身體將會出現異常。
甲狀腺機能亢進症( Hyperthyroidism)常見於貓，發生的原因不明，甲狀腺惡性腫瘤較少見，而營養因素、環境中的毒素、免疫機制等皆有可能造成。診斷此病需靠臨床症狀和驗血結果( TT4、fT4濃度上升，TSH濃度下降)做確診。臨床症狀通常是緩慢漸進性地發展，包括體重下降、多尿、多渴、多食、躁動、披毛雜亂不堪及抗壓性低有攻擊性，有時會出現嘔吐、下痢，有少部分會呈現精神萎靡，也可能會出現呼吸困難、急促等狀況。治療方式有三種，藥物治療、手術治療及放射線治療。治療效果多是成功的，除非是腺癌引起甲狀腺機能亢進，或是併發擴張型心肌症或腎衰竭。預後如有伴隨惡病質、腎衰竭或心臟疾病等而將呈現不佳。
甲狀腺功能低下症( Hypothyroidism )常見於狗，在貓是比較少見。分兩類型先天型和後天型。先天型(幼年時期發作)較少見。後天型原發於甲狀腺體異常，多是因淋巴性甲狀腺炎、或甲狀腺萎縮所引發，後天型還有繼發於腦下垂體或甲狀腺腫瘤，或者是醫源性引發，如雙側甲狀腺切除術或是採用放射性碘治療甲狀腺機能亢進症。症狀有雙側對稱性脫毛、皮膚色素沉澱、粗糙的皮毛、皮脂漏、懶散怕冷、輕微地體重增加、便秘、黏液性水腫、奇怪的臉部表情和可能會發生不孕的情形，還有不典型的情況有緩慢而僵硬的步伐(肌肉方面的病狀)、跛腳、本體感覺喪失、頭側偏、眼震、喉頭麻痺(周邊神經症狀)、精神遲鈍、抽蓄或昏迷(中樞神經症狀)。後天型發病多需靠臨床症狀和驗血結果(TT4、fT4濃度降低、TSH濃度升高)做確診，治療方式為給予口服甲狀腺素藥物且定期回診以監測病況及血中甲狀腺素濃度，大多數都預後良好。
